Desenvolvido na cidade em 2013, o Enseada Limpa é responsável por recuperar a balneabilidade da enseada de Jurujuba e São Francisco. A iniciativa integra o saneamento básico da cidade, que atualmente caminha para a universalização, e é responsável por permitir que Niterói saísse da marca de menos de 10% de balneabilidade, para alcançar mais de 60% nos dias atuais. A despoluição da Baía de Guanabara é um desejo de muitos e segundo a prefeitura, o Programa Enseada Limpa vai permitir que Niterói seja a responsável por recuperar e despoluir a primeira parte do local. Assim, com a recuperação da balneabilidade de Jurujuba e São Francisco, a cidade pretende ter as primeiras áreas consideradas limpas na Baía.
